La nave de la iglesia está salpicada de trece lápidas sepulcrales, algunas de las cuales son de fina factura.

Entre estas se encuentra la situada en el altar de la Madonna delle Grazie; la inscripción en la losa indica que esta cripta es el lugar de enterramiento de mujeres devotas de la Virgen.

La losa está enmarcada por una cubierta de piedra que presenta cuatro cráneos en bajorrelieve y otras inscripciones de memento mori.

Otra lápida sepulcral, situada cerca de la entrada, está enmarcada por una estrella de ocho puntas.

El pavimento está compuesto predominantemente por baldosas hexagonales de terracota. Se han encontrado baldosas de cerámica bicromadas dentro de la capilla gótico-normanda y en la entrada de la capilla del Santísimo Crucifijo.