Das Kirchenschiff ist mit dreizehn Grabplatten übersät, von denen einige von ausgezeichneter Handwerkskunst sind.

Unter diesen befindet sich die Platte am Altar der Madonna delle Grazie; die Inschrift auf der Platte zeigt an, dass diese Krypta der Begräbnisort von Frauen ist, die der Jungfrau ergeben sind.

Die Platte ist von einer Steineinfassung umrahmt, die vier Totenköpfe im Flachrelief und andere Memento-Mori-Gravuren aufweist.

Eine weitere Grabplatte, die sich in der Nähe des Eingangs befindet, ist von einem achtzackigen Stern umrahmt.

Der Boden besteht überwiegend aus sechseckigen Terrakottafliesen. Zweifarbige Keramikfliesen wurden in der gotisch-normannischen Kapelle und am Eingang zur Kapelle des Heiligen Kruzifixes gefunden.